Pelas suas caraterísticas ímpares, a Herdade da Contenda representa um território com
vocação para o desenvolvimento de atividades de estudo e investigação, as quais remontam ao final da década de 1950, quando foram desenvolvidos os primeiros projetos de florestação. Constitui ainda um importante centro de educação ambiental e ligação à comunidade, quer através do Centro Nacional de Caça e Biodiversidade, quer do
aprofundamento das relações protocolares com diversas entidades, designadamente o Instituto de Conservação da Natureza e Florestas, a Liga de Proteção da Natureza, a Empresa de Desenvolvimento e Infra-estruturas do Alqueva, S.A., a ERENA–Ordenamento e Gestão dos Recursos Naturais e agentes espanhóis, para a criação de condições para a reintrodução do lince ibérico e do abutre preto.
Pela sua importância e biodiversidade, a Herdade da Contenda integra uma Zona de Protecção Especial e um Sitio de Importância Comunitária da Rede Natura 2000.
